Eine Beschreibung der temperaturbedingten Vegetationsstufen zeigt die natürliche Pflanzengemeinschaft in einer Höhenentwicklung von 800 – 3.000 m. Höchst bedeutsam für die herausragende Schutzwürdigkeit als Nationalpark ist insbesondere, dass überall dort, wo der Waldtyp „Bergmischwald“ stocken kann, dieser auch im Gebiet vorkommt. Damit enthält der Nationalpark-Vorschlag das größte geschlossene Bergmischwald-Vorkommen Deutschlands. Wald-systematisch gehört dieser Bergmischwald zu den Buchen- und Buchenmischwäldern.

Das Ammergebirge ist wahrscheinlich neben den Allgäuer Hochalpen das pflanzen- und tierartenreichste terrestrische Großökosystem Deutschlands.

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